中大新聞網訊（通訊員施莽）近日，中山大學醫學院施莽教授團隊與南京農業大學等單位共同合作在Cell雜志上發表題為“Virome characterization of game animals in China reveals a spectrum of emerging pathogens”的研究論文。這是我校醫學院自建院以來首次以共同通訊作者單位名義在頂級學術期刊Cell發表研究成果。

該論文利用宏轉錄組的方法系統探索了包括果子貍、穿山甲、豪豬等在內的18種“野味”哺乳動物的病毒組，發現并且評估了超過102種哺乳動物相關的病毒，其中包括21種和人類致病密切相關的病原體，為“野味”動物攜帶并傳播高危病原提供了重要理論依據，并且為下一次疾病暴發提出預警。

新型冠狀病毒肺炎（Corona Virus Disease 2019，COVID-19）大流行使得全球野生動物貿易（即“野味”動物）引起了公眾的廣泛關注。由于不同種類“野味”動物在較小空間內的集中飼養、運輸和販賣，使得其攜帶的各種原本致病性低的病毒也可在不同物種間傳播、變異、重組，最終有機會演變成可以感染人的高危病毒。因此，開展“野味”動物的病毒譜調查對全人類乃至全球新發傳染病的防控和預警具有非常重要的意義。

本研究采用高通量宏轉錄組學的方法對來自中國20個省份的1941只“野味”動物展開了大規模系統的病毒組調查。覆蓋五個哺乳動物類群：嚙齒目、有鱗目、食肉目、猬形目和兔形目，包括豪豬、竹鼠、土撥鼠、果子貍、貉和穿山甲等（圖1）。該方法能夠快速有效地揭示這些不同來源樣本中已知和未知的病毒病原體，并通過生物信息學分析篩選“威脅人類健康”的病原體，大大提高了新病毒和已知病毒發現的效率。

圖1 本研究涉及的“野味”動物種類和地域分布

基于這種方法，本研究一共鑒定到102種能感染哺乳動物的病毒，其中包括65種之前從未被報道過的新病毒，這些病毒的多樣性覆蓋13個病毒科。其中尤其值得關注的是多種人畜共患病病毒（圖2）。例如，本研究在流鼻涕的狗獾和健康的果子貍中都發現了禽流感H9N2的存在，腹瀉的果子貍樣本中發現了諾如病毒，多疾病并發的穿山甲樣本中發現了人副流感病毒（II型），以及腹瀉的貉中發現了輪狀病毒以及犬冠狀病毒等等，其中本研究發現犬冠狀病毒有多重重組歷史，與最近報道的來自馬來西亞和海地的可導致人類疾病的重組CCoV毒株具有93.65-94.27%的基因組一致性。以上結果表明人與“野味”動物之間的密切交流可造成“野味”動物到人或者人到“野味”動物的雙向的病原傳播和交流。

此外，本研究還發現一些病毒可以在不同類別的野生和“野味”動物之間傳播，比如在腹瀉的果子貍樣本中鑒定到一種來源于蝙蝠的alpha冠狀病毒BtCoV-HKU8，這表明該病毒已經克服了宿主屏障完成了從自然宿主（蝙蝠）跨物種傳播到中間宿主（果子貍）的過程，下一階段極可能會通過進一步變異重組成為新的人類病原體。盡管如此，SARS-CoV和SARS-CoV-2相關的病毒序列并未在該研究的動物樣本中檢測到。

圖2 “野味”動物攜帶病毒組的多樣性

在鑒定到的102種脊椎動物相關病毒中，其中有21種病毒被認定為“高危”病毒，這些病原體或者是已知的人獸共患病原體或者表現出較高的跨物種傳播能力，是新發再發傳染病防范的重點目標。而不同種類的“野味”中，果子貍是所有物種中攜帶“高危”病毒數量最多的物種，且這些“高危”病毒在不同“野味”動物中也存在頻繁的跨物種傳播現象（圖3）。

圖3 “高危”病毒和“高危”“野味”動物之間的關系

最后，一些看似健康的動物也攜帶和人類致病密切相關的病毒，并且這些病毒在不同物種之間持續傳播。這些發現再次凸顯了交易、食用以及密切接觸野生動物的風險，揭示“野味”動物作為新發再發傳染病出現的重要驅動因素。

中山大學醫學院博士研究生侯新和南京農業大學的何婉婷與趙晉為本文共同第一作者，中山大學醫學院施莽教授、南京農業大學粟碩教授和悉尼大學Edward Holmes教授為共同通訊作者。本研究受到國家重點研發計劃新冠專項、深圳市人才專項以及廣東省引進創新創業團隊等項目支持。

論文鏈接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867422001945