近日,我校附屬第五醫(yī)院院長單鴻教授課題組在生物學(xué)領(lǐng)域1區(qū)雜志Microbiome上發(fā)表了題為“A semi-tryptic peptide centric metaproteomic mining approach and its potential utility in capturing signatures of gut microbial proteolysis”的學(xué)術(shù)論文。
這是國內(nèi)團(tuán)隊在國際知名微生物期刊的首篇宏蛋白質(zhì)組方法學(xué)創(chuàng)新研究,文章揭示了腸道微生物蛋白酶解調(diào)控在炎癥性腸病(IBD)中的特異性變化,審稿專家對該方法的創(chuàng)新性均給予了很高的評價。附屬第五醫(yī)院分子影像中心嚴(yán)志祥副研究員為第一作者兼共同通訊作者,單鴻教授和消化內(nèi)科李嘯峰主任醫(yī)師為共同通訊作者。
蛋白酶解調(diào)控能通過快速降解錯誤折疊蛋白和激活調(diào)節(jié)蛋白,使腸道微生物快速響應(yīng)腸道環(huán)境的動態(tài)變化。該研究方法首次系統(tǒng)地揭示了腸道菌的蛋白酶解調(diào)控圖譜,在菌群結(jié)構(gòu)和蛋白質(zhì)豐度之外提供了菌群代謝和功能變化的另一層面的信息。菌群蛋白酶調(diào)控模式與β多樣性低度相關(guān)、與微生物的蛋白酶和分子伴侶有一定關(guān)聯(lián)、與宿主蛋白酶抑制劑和抗體負(fù)相關(guān)。
研究發(fā)現(xiàn),炎癥性腸病(IBD)患者菌群蛋白酶調(diào)控變化主要涉及碳水化合物運(yùn)輸和代謝、氧化應(yīng)激、細(xì)胞運(yùn)動、蛋白質(zhì)合成和成熟。同時,該方法揭示了IBD患者菌群蛋白酶調(diào)控改變主要發(fā)生在回腸末端(克羅恩病)和降結(jié)腸(潰結(jié)性結(jié)腸炎),這與臨床IBD的病灶位置完全一致,顯示了該方法的準(zhǔn)確性及其在研究微生物介導(dǎo)的發(fā)病機(jī)制中的巨大潛力。
論文鏈接:https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-020-00967-x